شعبه کرمان مهرآفرین فعالیت خود را از سال ۱۳۸7 در راستای ارائه خدمات به زنان و کودکان بدسرپرست آغاز کرد. واحد مددکاری در حوزه خانواده و حوزه اعتیاد، واحد‌های فعال در شعبه کرمان هستند که به مادران و کودکان آسیب دیده خدمات مددکاری، آموزشی، معیشتی و درمانی ارائه می‌دهند. واحد سیرجان نیز از سال ۱۳۸۸ به مادران و کودکان آسیب دیده شهرستان سیرجان خدمات مددکاری، آموزشی، معیشتی و درمانی ارائه می‌دهد. همچنین واحد کوهبنان از سال ۱۳۹۷ فعالیت خود را آغاز کرد و به جامعه هدف یعنی زنان و کودکان بدسرپرست و در معرض آسیب خدمات حمایتی شامل معیشتی، آموزشی و درمانی ارائه می‌دهد. مرکز حمایت‌های روانی اجتماعی ندای مهر نیز تحت نظر مهرآفرین و با حضور روانشناس و مددکاران اجتماعی، به دختران ۱۲ تا ۳۵ سال در معرض آسیب‌های اجتماعی، خدمات روزانه حمایتی ارائه می‌دهد. مهرآفرین در استان کرمان صاحب سه خانه کودک و نوجوان است که خانه مهر ویژه نگهداری شبانه روزی از دختران بدسرپرست ۷ تا ۱۲ سال و خانه مهر مادری ویژه دختران ۱۲ تا ۱۸ سال در شهر کرمان واقع شده‌اند. هر یک از این خانه‌ها ظرفیت اقامت ۱۵ تا ۲۰ کودک و نوجوان را دارند و ساختمان آن‌ها توسط خیرین در اختیار مهرآفرین قرار گرفته است. خانه مهر ماهنوش نیز در سال ۱۴۰۰ در شهر رفسنجان مورد بهره‌برداری قرار گرفت. بنای این خانه توسط خانواده بانوی جوانی به اسم ماهنوش که در اثر بیماری سرطان درگذشته است، با تمام جهیزیه این بانو به مهرآفرین اهدا شد. این خانه مختص نگهداری از کودکان بدسرپرست و آسیب دیده شهر رفسنجان است.