شعبه زنجان موسسه خیریه مهرآفرین فعالیت خود را از بهمن‌ماه سال ۱۳۹۶ با هدف ارائه خدمات حمایتی، آموزشی و درمانی به کودکان و خانواده‌های آسیب‌دیده آغاز کرد. در این شعبه، واحدهای مددکاری در حوزه خانواده و اعتیاد فعال هستند و با ارائه خدمات تخصصی در زمینه مشاوره، مداخلات مددکاری، آموزش مهارت‌های زندگی، تأمین معیشت و پیگیری درمان، به مادران و کودکان در معرض آسیب کمک می‌کنند تا مسیر توانمندسازی را طی کنند. از خرداد ۱۴۰۴، با افتتاح خانه مهر آتا در شهر زنجان، ظرفیت خدمات‌رسانی این شعبه گسترش یافته است. خانه مهر آتا مرکزی روزانه با فضای شاد و آموزشی است که خدماتی از جمله آموزش مهارت‌های فردی و اجتماعی، کارگاه‌های توانمندسازی، خدمات روانشناسی و مددکاری و تغذیه روزانه را به کودکان و مادران تحت حمایت ارائه می‌دهد. شعبه زنجان مهرآفرین با بهره‌گیری از توان متخصصان، یاوران محلی و فضای مناسب، تلاش می‌کند تا مأمنی مطمئن برای کودکانی باشد که در معرض تهدیدهای خانوادگی و اجتماعی قرار دارند، و راهی به‌سوی آینده‌ای روشن‌تر برای آنان فراهم کند.