شعبه همدان مهرآفرین فعالیت خود را در سال ۱۴۰۲ باهدف حمایت از زنان و کودکان بدسرپرست آغاز کرد. در این شعبه خدمات معیشتی، آموزشی و کاهش آسیب به مادران و کودکان آسیب‌دیده ارائه می‌شود. ساختمان دفتر مهرآفرین در شهر همدان توسط یکی از نیکوکاران بنام این شهر به موسسه اهدا شده است.