شعبه کرج مهرآفرین از سال ۱۳۹4 فعالیت خود را در زمینه حمایت از مادران و کودکان بدسرپرست آغاز کرد. این شعبه با دو واحد فعال در زمینه خانواده و اعتیاد، خدمات مددکاری اجتماعی تخصصی، شامل خدمات آموزشی، معیشتی، درمانی و کاهش آسیب را به خانواده‌های تحت حمایت مؤسسه در استان البرز ارائه می‌کند. شعبه مهرآفرین در استان البرز دارای یک مهدکودک ویژه نگهداری از کودکان آسیب دیده زیر ۷ سال است. همچنین دو خانه کودک و نوجوان ویژه دختران ۷ تا ۱۲ سال(خانه مهر فرشته) و پسران ۷ تا ۱۲ سال (خانه مهر نیکان) در این استان دایر است.